กลุ่มชีวสารสนเทศศาสตร์ของ James Hutton Institute ภายใน Department of Information and Computational Sciences ได้เปิดตัว Germinate เวอร์ชันใหม่ ซึ่งเป็นโอเพ่นซอร์สของโครงสร้างพื้นฐานฐานข้อมูลพืชที่มีคุณลักษณะครบถ้วนและแพลตฟอร์มการเขียนโปรแกรมแอปพลิเคชัน ซึ่งสามารถจัดเก็บข้อมูลที่ซับซ้อนจากการรวบรวมทรัพยากรพันธุกรรมได้ สืบค้นและแสดงภาพโดยใช้ส่วนประกอบการเขียนโปรแกรมทั่วไปที่ใช้ซ้ำได้
ปัจจุบัน Germinate ถูกใช้โดยองค์กรวิจัยระดับนานาชาติจำนวนมาก
ซึ่งรวมถึง Crop Trust และ CIMMYT เพื่อเก็บข้อมูลการทดลองสำหรับพืชผลที่แตกต่างกัน 21 ชนิด ซึ่งช่วยให้นักวิจัยนำเข้า แสดงภาพ สำรวจ และแบ่งปันข้อมูลโครงการสำหรับการรวบรวมทรัพยากรพันธุกรรมพืชผ่านอินเทอร์เฟซทั่วไป ดร.พอล ชอว์ ผู้นำโครงการ Germinate กล่าวว่า “Germinate มีข้อได้เปรียบเหนือแพลตฟอร์มซอฟต์แวร์ทรัพยากรพันธุกรรมพืชอื่นๆ โดยการจัดหาเครื่องมือบนเว็บเพื่อให้สามารถรวมข้อมูลจีโนไทป์ ฟีโนไทป์ และหนังสือเดินทางที่มีปริมาณมาก ซึ่งมีความสำคัญในการจัดหมวดหมู่พืช การรวบรวมทรัพยากรพันธุกรรม เราได้พัฒนาคุณสมบัติใหม่สำหรับ Germinate ซึ่งจะช่วยให้นักปรับปรุงพันธุ์พืชและนักวิทยาศาสตร์คนอื่นๆ สามารถสำรวจ แสดงภาพ และส่งออกข้อมูลไปยังเครื่องมือวิเคราะห์อื่นๆ ที่ใช้กันทั่วไปได้จากแพลตฟอร์มเดียว ทีมงานได้ใส่ทรัพยากรที่สำคัญเพื่อให้แน่ใจว่า Germinate เวอร์ชันใหม่มีการปรับปรุงที่สำคัญกว่ารุ่นก่อน
“ในขณะที่ Germinate สนับสนุนพืชผลที่มีความสำคัญต่อสกอตแลนด์ เช่น ข้าวบาร์เลย์ ผลไม้เนื้ออ่อน เชอร์รี่ และมันฝรั่ง ผลงานล่าสุดของเราช่วยให้เราสามารถปรับใช้แพลตฟอร์มนี้กับพืชผลที่มีความสำคัญต่อประเทศกำลังพัฒนา การใช้ซอฟต์แวร์ที่พัฒนาขึ้นที่นี่ที่สถาบันเพื่อสนับสนุนพืชผลหลักของเรา การขยายและปรับปรุงคุณสมบัติสำหรับการใช้งานในที่อื่น ๆ นั้นยอดเยี่ยมสำหรับแพลตฟอร์มและมอบเครื่องมือและทรัพยากรสารสนเทศที่พืชผลเหล่านั้นยังไม่มี”
เมื่อเร็วๆ นี้ Germinate ยังได้รับการสนับสนุนจากDivSeek Internationalให้ดำเนินการเป็นศูนย์กลางนำร่องเพื่อส่งเสริมการใช้แพลตฟอร์มเป็นกลไกการกระจายข้อมูล ตลอดจนแนวทางปฏิบัติในการจัดการข้อมูลที่ดีทั่วไปสำหรับข้อมูลทรัพยากรพันธุกรรมพืช และจะใช้คอลเลกชันข้าวบาร์เลย์จาก James Hutton Institute และ Commonwealth Potato Collection เป็นแบบอย่างในการเน้นย้ำถึงสิ่งที่ระบบสามารถทำได้
Sebastian Raubach หัวหน้านักพัฒนาซอฟต์แวร์ของ Germinate กล่าวเสริมว่า: “เวอร์ชันใหม่นำเสนอการอัปเดตที่สำคัญสำหรับแพลตฟอร์ม Germinate รวมถึงการส่งออกข้อมูลแบบอะซิงโครนัส การตรวจสอบและนำเข้าข้อมูลกึ่งอัตโนมัติ การติดตั้งที่ง่ายขึ้น การแสดงภาพเพิ่มเติม และการอัปเดตอื่นๆ เบื้องหลังเพื่อปรับปรุง ใช้งานง่ายและลดอุปสรรคสำหรับผู้ใช้ใหม่ในขณะที่ยังคงรักษาคุณสมบัติขั้นสูงสำหรับผู้ใช้ที่มีประสบการณ์”
เครื่องมือและคุณลักษณะใหม่เหล่านี้ ตลอดจนคำอธิบายของงานที่กลุ่มดำเนินการกับ Crop Trust สามารถพบได้ในสิ่งพิมพ์ที่ได้รับการยอมรับเมื่อเร็ว ๆ นี้ของพวกเขา”จากบิตสู่การกัด: ความก้าวหน้าของแพลตฟอร์มการงอกเพื่อสนับสนุนการรวบรวมทรัพยากรพันธุกรรมและก่อน- ข้อมูลการเพาะพันธุ์พืชพันธุ์ญาติป่า” (
Credit : aliasrevista.net franxophonie.org talesofmonkeyisland-game.com bronxyouthheard.org dagangasia.net obamastinks.net shauncassidy.net outletbotastimberland.com flying-for-the-cure.org 2014sjordanxilowconcord.com
